Der schmale LED-Doppelscheinwerfer trägt nicht nur zum markanten Look der Ninja 400 bei, er sorgt auch für gute Sichtbarkeit und hohe Leuchtkraft.

Mit einem Hubraum von 399 cm3 bietet der Motor erheblich mehr Leistung im Vergleich zur Ninja 300r: 33,4 kW (plus 4,4 kW zur Ninja 300 MJ 2017). Dies ist vor allem auf die Fallstrom-Anordnung der Einspritzanlage zurückzuführen, die zusammen mit dem größeren Luftfiltergehäuse die Ansaugeffizienz verbessert. Das sanfte Ansprechverhalten und das vorhandene Drehmoment bei tiefen Drehzahlen vereinfachen die Kontrollierbarkeit.

Die Instrumenteneinheit der Ninja 400 verfügt über einen großen analogen Drehzahlmesser, neben dem sich auf der einen Seite die Warnleuchten und auf der anderen eine Ganganzeige sowie eine Multifunktions-LCD-Anzeige befindet.

Mit einem Durchmesser von 310 mm bietet die semischwimmend gelagerte Vorderrad-Bremsscheibe der Ninja 400 sichere Bremsleistung. Der Hauptbremszylinder vorn verschafft der Bremse ein direkteres Ansprechverhalten. Zudem wurden die Maße und Materialien für die Bremsleitung sorgfältig ausgewählt, um ein gutes Feedback und optimale Kontrollierbarkeit beim Bremsen zu gewährleisten. Das Hinterrad wird durch eine φ220 mm Petal-Bremsscheibe und einem Doppelkolben-Schwimmsattel abgebremst.

Die Sitzposition ist  für ein breites Spektrum an Fahrergrößen und Fahrsituationen geeignet. Die erhöhte Lenkerposition und die leicht nach vorne verlagerte Position der Fußrasten versetzen den Fahrer in eine optimale Fahrhaltung, die eine bessere Kontrolle des Motorrads ermöglicht, ohne es an Fahrkomfort vermissen zu lassen.

Die Sitzhöhe beträgt nur 785 mm. In Verbindung mit dem schlanken Design von Fahrersitz und Motor kann der Fahrer bequem mit den Füßen den Boden erreichen.

Das Aussehen einer Ninja hat schon immer die Blicke anderer auf sich gezogen. Die Ninja 400 trägt stolz das futuristische, Ninja-Styling unter anderem inspiriert durch die legendäre Ninja H2. Die Form der Verkleidung erzeugt die Optik eines leistungsstarken Motorrads, dessen Eindruck nur noch vom hochwertigen Design und dem erstklassigen Finish verstärkt wird.

Die Ninja 400 besitzt einen Gitterrohrrahmen, der dem der Ninja H2 ähnelt. Der Motor ist starr montiert und dient als tragendes Element. Dank der neuen Rahmenkonstruktion ist das Gewicht des Motorrads deutlich niedriger.